都市轻化工业实验教学中心实行主任负责制，由中心主任统筹安排、调配、使用实验教学资源和相关教育资源，实现优质资源共享，统一组织开展实验教学、实验教学改革与建设、实验室管理等各项工作。实验教学经费由学校下拨，实验教学方面的任务和要求由教务处与学院下达，学科建设和人员管理归属二级学院管理，形成了校院二级职责明晰并有机结合的二级管理体制与运行模式。